Τριάντα χρόνια μετά το τέλος του πολέμου, η Βοσνία-Ερζεγοβίνη φέρει ακόμη τα σημάδια των εκστρατειών εθνοκάθαρσης που έπληξαν τη χώρα, στοιχίζοντας τη ζωή σε περίπου 100.000 ανθρώπους και εκτοπίζοντας πάνω από δύο εκατομμύρια. Ο πόλεμος 1992-1995, που πυροδοτήθηκε από εθνοτικές εντάσεις και ανταγωνιστικά εθνικιστικά σχέδια μετά τη βίαιη διάλυση της Γιουγκοσλαβίας, χαρακτηρίστηκε από τη συστηματική στόχευση αμάχων και κορυφώθηκε με τη γενοκτονία της Σρεμπρένιτσα το 1995 – την χειρότερη θηριωδία που διαπράχθηκε στην Ευρώπη μετά τον Β’ Παγκόσμιο Πόλεμο.
Η Βοσνία ήταν μία από τις έξι δημοκρατίες της Σοσιαλιστικής Ομοσπονδιακής Δημοκρατίας της Γιουγκοσλαβίας, μιας ομοσπονδίας που δημιουργήθηκε κατά τον Β’ Παγκόσμιο Πόλεμο και διατηρήθηκε για δεκαετίες υπό τον Πρόεδρο Τίτο. Μετά τον θάνατό του το 1980, η οικονομική κατάρρευση και ο αυξανόμενος εθνικισμός, ιδιαίτερα στη Σερβία και την Κροατία, οδήγησαν σε αιτήματα ανεξαρτησίας στις δημοκρατίες. Η Σλοβενία και η Κροατία κήρυξαν την ανεξαρτησία τους το 1991, με τη Μακεδονία να ακολουθεί στις αρχές του 1992, επιταχύνοντας τη διάλυση της Γιουγκοσλαβίας.
Την 1η Μαρτίου 1992, η Βοσνία-Ερζεγοβίνη διεξήγαγε δημοψήφισμα, στο οποίο το 99,7% των συμμετεχόντων ψήφισαν υπέρ της ανεξαρτησίας. Ωστόσο, οι περισσότεροι Βόσνιοι Σέρβοι μποϊκόταραν την ψηφοφορία και αντ’ αυτού δημιούργησαν τις δικές τους «Σερβικές Δημοκρατικές» δομές, που αργότερα έγιναν η οντότητα Republika Srpska (RS) εντός της Βοσνίας. Η προσπάθεια της Βοσνίας για ανεξαρτησία εξελισσόταν επίσης στο πλαίσιο της επιθετικής αυτονομιστικής πολιτικής της Σερβίας υπό τον Σλόμπονταν Μιλόσεβιτς, ο οποίος επιδίωκε να ενώσει περιοχές με σερβικό πληθυσμό στη Βοσνία και την Κροατία.
Η Ευρωπαϊκή Κοινότητα αναγνώρισε τη Βοσνία-Ερζεγοβίνη ως ανεξάρτητο κράτος στις 6 Απριλίου 1992. Τον ίδιο μήνα, οι Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις, υποστηριζόμενες από τον Γιουγκοσλαβικό Λαϊκό Στρατό και παραστρατιωτικές ομάδες, εξαπέλυσαν συντονισμένες επιθέσεις εντός της χώρας για να καταλάβουν εδάφη και να εκδιώξουν μη-Σερβικές κοινότητες. Στις 5 Απριλίου, η πρωτεύουσα Σαράγεβο πολιορκήθηκε από Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις, στη μεγαλύτερη πολιορκία πόλης στη σύγχρονη ευρωπαϊκή ιστορία. Για σχεδόν 43 μήνες, οι επιτιθέμενες δυνάμεις βομβάρδιζαν κατοικημένες περιοχές, διέκοπταν την ηλεκτροδότηση και το νερό και έσφιγγαν τον κλοιό γύρω από την πρωτεύουσα, σκοτώνοντας περίπου 11.000 ανθρώπους.
Λίγο μετά την έναρξη αυτής της επίθεσης, το Συμβούλιο Ασφαλείας των Ηνωμένων Εθνών επέβαλε αυστηρές κυρώσεις στη Σερβία και το Μαυροβούνιο για την υποστήριξη των προσπαθειών για διάσπαση της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης. Τον Οκτώβριο του 1992, Κροατικές δυνάμεις επιτέθηκαν επίσης σε περιοχές των Μποσνιάκων (Βόσνιων Μουσουλμάνων) γύρω από το Prozor στη νοτιοδυτική Βοσνία, σηματοδοτώντας την έναρξη μιας ξεχωριστής Κροατο-Βοσνιακής σύγκρουσης που έφερε τις δικές της εκστρατείες εθνοκάθαρσης.
Μια ερευνητική μεταπολεμική μελέτη που ανέθεσαν οι βοσνιακές αρχές εκτίμησε ότι σκοτώθηκαν περίπου 104.000 άνθρωποι, οι περισσότεροι από τους οποίους ήταν άμαχοι. Περίπου τα δύο τρίτα των νεκρών ήταν Μποσνιάκοι. Διεθνείς και βοσνιακές πηγές εκτιμούν ότι περίπου 2,2 εκατομμύρια άνθρωποι, πάνω από τον μισό προπολεμικό πληθυσμό, εκτοπίστηκαν από τα σπίτια τους ως πρόσφυγες ή εσωτερικά εκτοπισμένοι. Οι περισσότεροι δεν μπόρεσαν ποτέ να επιστρέψουν.
Από την αρχή, ο πόλεμος χαρακτηρίστηκε από συστηματική εθνοκάθαρση –ιδιαίτερα των Μποσνιάκων– δολοφονίες, μαζικούς βιασμούς, αναγκαστικούς εκτοπισμούς και την καταστροφή πολιτιστικών και θρησκευτικών χώρων. Στην βορειοδυτική περιοχή Prijedor, οι αρχές των Βοσνίων Σέρβων δημιούργησαν στρατόπεδα κράτησης, συμπεριλαμβανομένων των Omarska, Keraterm και Trnopolje, όπου χιλιάδες Βόσνιοι Μουσουλμάνοι και Βόσνιοι Κροάτες πολίτες ξυλοκοπήθηκαν, βασανίστηκαν, βιάστηκαν και δολοφονήθηκαν. Έρευνες του Διεθνούς Ποινικού Δικαστηρίου για την πρώην Γιουγκοσλαβία (ICTY) περιέγραψαν τα εγκλήματα ως «εκτεταμένα και συστηματικά», στοχεύοντας πολίτες μη-Σερβικής καταγωγής.
Στην ανατολική Βοσνία, Μποσνιάκοι δολοφονήθηκαν ή εκδιώχθηκαν, και γυναίκες και νεαρά κορίτσια υποβλήθηκαν σε οργανωμένους βιασμούς. Η υπόθεση Foca του ICTY καθόρισε τον βιασμό και τη σεξουαλική υποδούλωση ως εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας. Η πρωτεύουσα, μια πολυεθνική πόλη, περικυκλώθηκε από Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις που βομβάρδιζαν κατοικημένες περιοχές και χρησιμοποιούσαν ελεύθερους σκοπευτές για να στοχεύουν πολίτες στους δρόμους, στις αγορές και στις ουρές για νερό. Η πολιορκία διήρκεσε από τον Απρίλιο του 1992 έως τον Φεβρουάριο του 1996 και στοίχισε τη ζωή σε περίπου 11.000 ανθρώπους, συμπεριλαμβανομένων πάνω από 1.000 παιδιών.
Τον Απρίλιο του 1993, Κροατικές δυνάμεις σκότωσαν πάνω από 100 άμαχους Μποσνιάκους στο χωριό Ahmici, κεντρική Βοσνία, και έκαψαν σπίτια και τζαμιά. Δικαστικές αποφάσεις του ICTY χαρακτήρισαν την ενέργεια ως μία από τις χειρότερες πράξεις εθνοκάθαρσης στην περιοχή. Το ICTY και οργανώσεις ανθρωπίνων δικαιωμάτων τεκμηρίωσαν επίσης ότι ο βιασμός χρησιμοποιήθηκε ως όργανο τρόμου, ιδιαίτερα στη Foca – που σήμερα βρίσκεται στην Republika Srpska στα νοτιοανατολικά της χώρας – όπου γυναίκες και κορίτσια κρατούνταν σε «στρατόπεδα βιασμών».
Το Σαράγεβο παρέμεινε υπό πολιορκία. Τον Φεβρουάριο του 1994, επίθεση μελών του πυροβολικού στην αγορά Markale σκότωσε 68 αμάχους και τραυμάτισε πολλούς περισσότερους. Μια δεύτερη επίθεση στην ίδια αγορά τον Αύγουστο του 1995 σκότωσε 43 άτομα. Δικαστικές αποφάσεις του ICTY και ερευνητές των Ηνωμένων Εθνών απέδωσαν την ευθύνη για αυτές τις επιθέσεις στις Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις. Αυτές και άλλες επιθέσεις σε λεγόμενες «ασφαλείς ζώνες» αύξησαν την πίεση προς το ΝΑΤΟ και τις δυτικές κυβερνήσεις να δράσουν, θέτοντας τις βάσεις για βαρύτερες αεροπορικές επιθέσεις εναντίον της ηγεσίας των Βοσνίων Σέρβων αργότερα το 1995.
Κατά τη διάρκεια της πολιορκίας του Σαράγεβο, οι πολίτες υποβάλλονταν σε «σαφάρι ελεύθερων σκοπευτών» – έτσι ονομάστηκαν ως μια γκροτέσκα αναφορά σε κυνηγετικές εκστρατείες – όπου ξένοι πλήρωναν Βόσνιο-Σερβικές μονάδες για να συμμετάσχουν και να πυροβολήσουν πολίτες από θέσεις που επέβλεπαν την πόλη. Μετά από μια πρόσφατη ιταλική έρευνα, εισαγγελείς στο Μιλάνο εξετάζουν εάν εύποροι επισκέπτες από την Ιταλία και άλλες χώρες ταξίδεψαν στο Σαράγεβο σε οργανωμένες «εκδρομές» για να πυροβολήσουν αμάχους για χάρη του αθλήματος. Κανείς δεν έχει ακόμη καταδικαστεί για οργάνωση ή συμμετοχή σε αυτά τα «σαφάρι», αλλά οι ισχυρισμοί υπογραμμίζουν την ακραία αποανθρωποποίηση που συνόδευε την πολιορκία της πόλης. Πιστεύεται ότι πολίτες από πολλές χώρες συμμετείχαν. Το 2022, ο Βόσνιος σκηνοθέτης Miran Zupanic, στο ντοκιμαντέρ του Sarajevo Safari, ερεύνησε εύπορους ξένους που είχαν συμμετάσχει, συμπεριλαμβανομένων ορισμένων από τις Ηνωμένες Πολιτείες και τη Ρωσία. Επιπλέον, το 2007, ο πρώην Αμερικανός πεζοναύτης John Jordan κατέθεσε στο ICTY ότι «τουρίστες σκοπευτές» είχαν έρθει στο Σαράγεβο.
Μέχρι το 1995, η Σρεμπρένιτσα, μια πόλη στην ανατολική Βοσνία, είχε γίνει καταφύγιο για δεκάδες χιλιάδες Μποσνιάκους που διέφυγαν από τα γύρω χωριά, τα οποία είχαν λεηλατηθεί από Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις που τους καταδίωκαν. Ο θύλακας ήταν υπερπλήρης και εξαρτιόταν από ακανόνιστες αποστολές βοήθειας του ΟΗΕ, ενώ οι Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις έλεγχαν τις γύρω περιοχές. Παρόλο που ο ΟΗΕ είχε κηρύξει τη Σρεμπρένιτσα προστατευόμενη ζώνη και είχε αναπτύξει μια μικρή ολλανδική ειρηνευτική μονάδα, ο θύλακας βρισκόταν υπό πολιορκία. Τον Μάρτιο του 1995, ο Βόσνιο-Σέρβος ηγέτης Radovan Karadzic εξέδωσε οδηγία που διέτασσε την πλήρη αποκλεισμό της Σρεμπρένιτσα.
Στις αρχές Ιουλίου 1995, Βόσνιο-Σερβικές δυνάμεις προέλασαν προς τον θύλακα. Στις 9 Ιουλίου, οι δυνάμεις του Karadzic έλαβαν εντολή να καταλάβουν τη Σρεμπρένιτσα και στις 11 Ιουλίου, ο Ratko Mladic, Βόσνιο-Σέρβος στρατιωτικός ηγέτης γνωστός ως «Χασάπης της Βοσνίας», εισήλθε στην πόλη. Τις επόμενες ημέρες, Βόσνιο-Σερβικές μονάδες διαχώρισαν άνδρες και αγόρια από γυναίκες και νεότερα παιδιά. Πάνω από 8.000 Βόσνιοι άνδρες και αγόρια εκτελέστηκαν σε τοποθεσίες εντός και γύρω από τη Σρεμπρένιτσα και τα σώματά τους απορρίφθηκαν σε ομαδικούς τάφους, ενώ περίπου 20.000 γυναίκες, παιδιά και ηλικιωμένοι εκτοπίστηκαν βίαια. Το ICTY και το Διεθνές Δικαστήριο της Δικαιοσύνης αργότερα έκκριναν ότι αυτές οι δολοφονίες αποτελούσαν γενοκτονία.
Οι δυτικές κυβερνήσεις δίσταζαν να παρέμβουν αποφασιστικά νωρίτερα στον πόλεμο, αλλά η γενοκτονία στη Σρεμπρένιτσα επέβαλε μια αλλαγή προσέγγισης. Τον Αύγουστο και Σεπτέμβριο του 1995, το ΝΑΤΟ εξαπέλυσε μια συνεχή αεροπορική εκστρατεία εναντίον των Βόσνιο-Σερβικών δυνάμεων – ένα σημείο καμπής που άνοιξε τον δρόμο για τη Συμφωνία Ειρήνης του Ντέιτον, η οποία τερμάτισε επίσημα τον πόλεμο. Οι διαπραγματεύσεις υπό την αιγίδα των ΗΠΑ έφεραν τους ηγέτες της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης, της Κροατίας και της τότε Ομοσπονδιακής Δημοκρατίας της Γιουγκοσλαβίας σε μια αεροπορική βάση κοντά στο Ντέιτον του Οχάιο, στις ΗΠΑ. Στις 21 Νοεμβρίου 1995, συμφώνησαν στο Γενικό Πλαίσιο Ειρήνης για τη Βοσνία-Ερζεγοβίνη, ευρύτερα γνωστό ως Συμφωνία Ειρήνης του Ντέιτον, η οποία διατήρησε τη Βοσνία ως ένα ενιαίο κράτος χωρισμένο σε δύο κύριες οντότητες – την Ομοσπονδία της Βοσνίας-Ερζεγοβίνης και την οντότητα Republika Srpska. Η συμφωνία υπεγράφη επίσημα στο Παρίσι στις 14 Δεκεμβρίου.
Η Συμφωνία Ειρήνης του Ντέιτον επρόκειτο να κάνει περισσότερα από το να τερματίσει τις ενεργές μάχες, και αναδιαμόρφωσε το μεταπολεμικό πολιτικό σύστημα. Η σημερινή Βοσνία έχει μια ιδιαίτερα αποκεντρωμένη δομή διακυβέρνησης, με δύο πολιτικές οντότητες καθώς και την τρίτη, αυτοδιοικούμενη Περιοχή Μπρτσκο, που μοιράζεται μεταξύ των άλλων δύο, και επίπεδα κρατικών θεσμών. Ένα ολόκληρο τμήμα της Συμφωνίας του Ντέιτον είναι αφιερωμένο σε πρόσφυγες και εκτοπισμένους κατά τη διάρκεια του πολέμου. Δηλώνει ρητά ότι «όλοι οι πρόσφυγες και οι εκτοπισμένοι έχουν το δικαίωμα να επιστρέψουν ελεύθερα στις πατρίδες τους» και να αποκαταστήσουν την ιδιοκτησία τους ή να λάβουν αποζημίωση αν αυτό δεν είναι δυνατό.
Ωστόσο, πολλοί ειδικοί περιγράφουν τη συμφωνία ως ελαττωματική στην πράξη, καθώς η υλοποίησή της υπήρξε τουλάχιστον μερική. Ενώ πολλοί άνθρωποι επέστρεψαν στα σπίτια τους και επεξεργάστηκαν εκατοντάδες χιλιάδες αιτήσεις ιδιοκτησίας, σημαντικός αριθμός Μποσνιάκων δεν μπόρεσε ποτέ να επιστρέψει στα προπολεμικά σπίτια τους. Υπήρχαν πολλοί λόγοι για αυτό, συμπεριλαμβανομένης της παρουσίας ναρκοπεδίων, του γεγονότος ότι τα σπίτια τους είχαν καταστραφεί, φόβου, οικονομικών δυσκολιών και συνεχιζόμενων, βαθιά ριζωμένων εθνοτικών εντάσεων. Σήμερα, ολόκληρες κοινότητες, ιδιαίτερα επιζώντες της γενοκτονίας της Σρεμπρένιτσα, παραμένουν αυτοεξόριστοι ή απλώς αναγκάστηκαν να επανεγκατασταθούν αλλού σε χώρες όπως οι ΗΠΑ και η Αυστραλία.
Το 1993, ο ΟΗΕ δημιούργησε το ICTY για να διώξει σοβαρές παραβιάσεις του διεθνούς ανθρωπιστικού δικαίου που διαπράχθηκαν στα Βαλκάνια. Το δικαστήριο λειτούργησε για 24 χρόνια, από το 1993 έως το 2017. Κατά τη διάρκεια περισσότερων από δύο δεκαετιών, μάρτυρες και επιζώντες κατέθεσαν για τις φρικαλεότητες και 161 άτομα κατηγορήθηκαν. Ενενήντα από αυτούς καταδικάστηκαν, 19 αθωώθηκαν, 20 είχαν αποσυρθεί οι κατηγορίες τους, 17 πέθαναν πριν από την καταδίκη, 13 παραπέμφθηκαν σε άλλα δικαστήρια και δύο δικάστηκαν εκ νέου. Τέσσερις τύποι εγκλημάτων καταγράφηκαν στο δικαστήριο – γενοκτονία, εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας, παραβιάσεις νόμων/εθίμων πολέμου και σοβαρές παραβιάσεις της Σύμβασης της Γενεύης.
Μεταξύ των ατόμων που δικάστηκαν από το δικαστήριο ήταν: Radovan Karadzic – ο πολεμικός ηγέτης των Βοσνίων Σέρβων. Το 2016, έλαβε ισόβια κάθειρξη για γενοκτονία, εγκλήματα κατά της ανθρωπότητας και εγκλήματα πολέμου, συμπεριλαμβανομένου του ρόλου του στη Σρεμπρένιτσα και την πολιορκία του Σαράγεβο. Το 2021, μεταφέρθηκε στην φυλακή υψίστης ασφαλείας, HMP Parkhurst, στο Isle of Wight, στα ανοιχτά των νοτιοανατολικών ακτών της Αγγλίας, Ηνωμένο Βασίλειο. Ratko Mladic – ο Βόσνιο-Σέρβος στρατιωτικός διοικητής. Το 2017, καταδικάστηκε επίσης σε ισόβια κάθειρξη για γενοκτονία και άλλα εγκλήματα. Κρατείται στη Μονάδα Κράτησης του ΟΗΕ στη Χάγη της Ολλανδίας. Βόσνιοι Κροάτες ηγέτες – αρκετοί καταδικάστηκαν για εγκλήματα κατά Μποσνιάκων κατά τη διάρκεια της Κροατο-Βοσνιακής σύγκρουσης. Δεκάδες αξιωματούχοι έχουν επίσης λάβει μακροχρόνιες ποινές φυλάκισης για εγκλήματα που σχετίζονται με τη γενοκτονία της Σρεμπρένιτσα, αν και πολλοί επιζώντες λένε ότι η δικαιοσύνη απέχει πολύ από το να έχει επιτευχθεί.
